Boven titel staat vermeld: De symbiose van biologie en technologie. Zowel vanuit het Applied Science onderwijs als vanuit het werkveld kwam er meer vraag om biologische expertise toe te voegen aan het bestaande lectoraat Thin Films & Functional Materials.
DOCUMENT
Plasma urokinase, a plasminogen activator immunochemically related to urinary urokinase (UK), was removed from human plasma (3.5 ng/ml) by immuno-depletion with antibodies raised against UK. The remaining plasminogen activator activity of the depleted plasma could not be inhibited by anti-UK antibodies and a sensitive ELISA for UK did not detect any UK levels that were higher than the background of the assay (0.1 ng/ml). However, when the depleted plasma was subjected to SDS-PAGE, substantial amounts of protein were found hereafter around 110 and 46 kD which now gave a positive reaction in the ELISA (35-350 ng/ml plasma). From these observations it is concluded that in human plasma two types of UK-related protein occur: Type I, among which the plasma urokinase, has antigenic determinants which are directly accessible to the anti-UK antibodies, Type II has determinants in a latent form. The function of the 110 kD type-II protein is that of a plasminogen activator; that of the 46 kD protein is not yet clear.
DOCUMENT
Background: Glucocorticoids are potent anti-inflammatory agents used for the treatment of diseases such as rheumatoid arthritis, asthma, inflammatory bowel disease and psoriasis. Unfortunately, usage is limited because of metabolic side-effects, e.g. insulin resistance, glucose intolerance and diabetes. To gain more insight into the mechanisms behind glucocorticoid induced insulin resistance, it is important to understand which genes play a role in the development of insulin resistance and which genes are affected by glucocorticoids. Medline abstracts contain many studies about insulin resistance and the molecular effects of glucocorticoids and thus are a good resource to study these effects. Results: We developed CoPubGene a method to automatically identify gene-disease associations in Medline abstracts. We used this method to create a literature network of genes related to insulin resistance and to evaluate the importance of the genes in this network for glucocorticoid induced metabolic side effects and anti-inflammatory processes. With this approach we found several genes that already are considered markers of GC induced IR, such as phosphoenolpyruvate carboxykinase (PCK) and glucose-6-phosphatase, catalytic subunit (G6PC). In addition, we found genes involved in steroid synthesis that have not yet been recognized as mediators of GC induced IR. Conclusions: With this approach we are able to construct a robust informative literature network of insulin resistance related genes that gave new insights to better understand the mechanisms behind GC induced IR. The method has been set up in a generic way so it can be applied to a wide variety of disease networks. © 2013 Fleuren et al.; licensee BioMed Central Ltd.
MULTIFILE
Het zwaartepunt van de ingenieursopleiding is aan het verschuiven. De Utrechtse ingenieur zal zijn werk en toegevoegde waarde steeds meer vinden op het terrein van ontwerpen. Aan het ontwerpproces zelf worden steeds zwaardere eisen gesteld. Constructie en productie vinden in toenemende mate elders in de wereld plaats. Gelet op deze outsourcing zal de ontwerper ook in staat moeten zijn het maakproces op afstand te besturen, zowel wat betreft kwaliteit en geld als qua tijd. Ontwerpen kan vanuit verschillende perspectieven beschouwd worden: vanuit de conceptuele fase, de realisatiefase (verdere aanpassingen) of de gebruiksfase (upgrading, bediening et cetera). Bij onderzoeksinstellingen als TNO, maar ook bij vooraanstaande bedrijven als OCE, Philips en ASML zien we dat steeds meer sprake is van een integrale ontwerpaanpak. Het tijdperk van massaproductie evolueert naar een tijdperk van maatwerk, waarin de behoeften van de gebruiker centraal staan. De interactie tussen de technologie en de gebruiker zal een steeds belangrijker plaats in gaan nemen, en juist op dit vlak zal de Utrechtse ingenieur zich onderscheiden.
DOCUMENT
Hoofdstuk 5 in Vitale clubs voor sport en samenleving: kennis-bron voor de stimulering van vitale en open sportverenigingen. Over Nederlandse sportverenigingen bestaan twee verhalen. Het eerste verhaal gaat over de kracht van het verenigingsleven. Het aantal vrijwilligers behoort tot het hoogste in de wereld. Er is bijna geen land met zo veel voetbalclubs als Nederland. Wekelijks worden ruim dertigduizend voetbalwedstrijden gespeeld. Naar schatting zijn daar zo’n 2,5 miljoen spelers, begeleiders en toeschouwers bij aanwezig. Wie de wedstrijden bezoekt, kent het plezier en de passie van de deelnemers. Het tweede verhaal gaat over de teloorgang van de vereniging. Het aantal vrijwilligers mag dan hoog zijn, toch hebben veel clubs last van een tekort aan vrijwilligers. De betrokkenheid van de vrijwilligers is bovendien losser en vrijblijvender geworden. Agressie in de sport is weliswaar niet nieuw, maar mensen hebben wel het idee dat deze toeneemt. Tot slot hebben verenigingen door de gemeentelijke bezuinigingen vaker moeite het hoofd boven water te houden. Veel onderzoek naar verenigingen gaat over de vraag in hoeverre bovenstaande verhalen met cijfers kunnen worden onderbouwd (Bijl, Boelhouwer, Pommer, & Sonck, 2013; Breedveld, Kamphuis, & Tiessen-Raaphorst, 2008; Gemeente Den Haag, 2012; Gemeente Rotterdam, 2010; Romijn & Van Kalmthout, 2012; Stichting Waarborgfonds Sport SWS, 2014; Van Kalmthout, 2011; Van Kalmthout, De Jong, & Lucassen, 2009; Van Kalmthout & Romijn, 2011; Van Kalmthout & Van der Werff, 2013). In welke mate en op welke vlakken zijn verenigingen vitaal? Interessant is de aanpak van het Mulier Instituut (zie ook hoofdstuk 3), die het functioneren van verenigingen op het vlak van leden, kader, activiteiten en financiën, jaarlijks onderzoekt en zo over een langere termijn kan bekijken. Hoewel longitudinale gegevens zicht bieden op de ontwikkeling van de vitaliteit van Nederlandse sportverenigingen en op knelpunten daarbij, geven ze geen inzicht in hoe zaken eventueel kunnen worden verbeterd. De afgelopen twee jaar deden we daar vanuit het lectoraat Participatie en Maatschappelijke Ontwikkeling (PMO) van Hogeschool Utrecht wel onderzoek naar (Verhagen, 2014
MULTIFILE
Background: G-protein coupled receptors (GPCRs) are involved in many different physiological processes and their function can be modulated by small molecules which bind in the transmembrane (TM) domain. Because of their structural and sequence conservation, the TM domains are often used in bioinformatics approaches to first create a multiple sequence alignment (MSA) and subsequently identify ligand binding positions. So far methods have been developed to predict the common ligand binding residue positions for class A GPCRs.Results: Here we present 1) ss-TEA, a method to identify specific ligand binding residue positions for any receptor, predicated on high quality sequence information. 2) The largest MSA of class A non olfactory GPCRs in the public domain consisting of 13324 sequences covering most of the species homologues of the human set of GPCRs. A set of ligand binding residue positions extracted from literature of 10 different receptors shows that our method has the best ligand binding residue prediction for 9 of these 10 receptors compared to another state-of-the-art method.Conclusions: The combination of the large multi species alignment and the newly introduced residue selection method ss-TEA can be used to rapidly identify subfamily specific ligand binding residues. This approach can aid the design of site directed mutagenesis experiments, explain receptor function and improve modelling. The method is also available online via GPCRDB at http://www.gpcr.org/7tm/. © 2011 Sanders et al; licensee BioMed Central Ltd.
DOCUMENT
Interview Eja Kliphuis in SURF Magazine, jaargang 15, nummer 3
DOCUMENT
According to the "membrane sensor" hypothesis, the membrane's physical properties and microdomain organization play an initiating role in the heat shock response. Clinical conditions such as cancer, diabetes and neurodegenerative diseases are all coupled with specific changes in the physical state and lipid composition of cellular membranes and characterized by altered heat shock protein levels in cells suggesting that these "membrane defects" can cause suboptimal hsp-gene expression. Such observations provide a new rationale for the introduction of novel, heat shock protein modulating drug candidates. Intercalating compounds can be used to alter membrane properties and by doing so normalize dysregulated expression of heat shock proteins, resulting in a beneficial therapeutic effect for reversing the pathological impact of disease. The membrane (and lipid) interacting hydroximic acid (HA) derivatives discussed in this review physiologically restore the heat shock protein stress response, creating a new class of "membrane-lipid therapy" pharmaceuticals. The diseases that HA derivatives potentially target are diverse and include, among others, insulin resistance and diabetes, neuropathy, atrial fibrillation, and amyotrophic lateral sclerosis. At a molecular level HA derivatives are broad spectrum, multi-target compounds as they fluidize yet stabilize membranes and remodel their lipid rafts while otherwise acting as PARP inhibitors. The HA derivatives have the potential to ameliorate disparate conditions, whether of acute or chronic nature. Many of these diseases presently are either untreatable or inadequately treated with currently available pharmaceuticals. Ultimately, the HA derivatives promise to play a major role in future pharmacotherapy.
LINK
Glucocorticoids (GCs) such as prednisolone are potent immunosuppressive drugs but suffer from severe adverse effects, including the induction of insulin resistance. Therefore, development of so-called Selective Glucocorticoid Receptor Modulators (SGRM) is highly desirable. Here we describe a non-steroidal Glucocorticoid Receptor (GR)-selective compound (Org 214007-0) with a binding affinity to GR similar to that of prednisolone. Structural modelling of the GR-Org 214007-0 binding site shows disturbance of the loop between helix 11 and helix 12 of GR, confirmed by partial recruitment of the TIF2-3 peptide. Using various cell lines and primary human cells, we show here that Org 214007-0 acts as a partial GC agonist, since it repressed inflammatory genes and was less effective in induction of metabolic genes. More importantly, in vivo studies in mice indicated that Org 214007-0 retained full efficacy in acute inflammation models as well as in a chronic collagen-induced arthritis (CIA) model. Gene expression profiling of muscle tissue derived from arthritic mice showed a partial activity of Org 214007-0 at an equi-efficacious dosage of prednisolone, with an increased ratio in repression versus induction of genes. Finally, in mice Org 214007-0 did not induce elevated fasting glucose nor the shift in glucose/glycogen balance in the liver seen with an equi-efficacious dose of prednisolone. All together, our data demonstrate that Org 214007-0 is a novel SGRMs with an improved therapeutic index compared to prednisolone. This class of SGRMs can contribute to effective anti-inflammatory therapy with a lower risk for metabolic side effects.
DOCUMENT
De probleemstelling van het onderzoek Teamkwaliteit en Onderwijskwaliteit is te plaatsen in de context van het onderzoeksdomein Kwaliteit van het HBO. De aanleiding van het onderzoek komt voort uit de interesse naar de redenen waarom opleidingen goed functioneren. De aanname die gemaakt is, is dat hoge kwaliteit van het onderwijs te maken heeft met hoge kwaliteit van de docententeams. Het onderzoek is uitgevoerd bij twee opleidingen van de Hogeschool Utrecht: de opleiding Personeel & Arbeid (P&A) van de faculteit Maatschappij en Recht en de opleiding Technische Bedrijfskunde (TBK) van de faculteit Natuur en Techniek. De keuze is op P&A en TBK gevallen vanwege hun hoge onderwijskwaliteit. Dat is een moeilijk te definiëren begrip en ik heb daartoe geen poging gedaan
DOCUMENT
