Ontwikkeling van een open source dashboard voor de analyse van transcriptomics data uit het 2RealGuts project (Open-2RealGuts)

Onze darmen spelen een centrale rol bij de gezondheidseffecten van voeding en voedingsingrediënten. Om op duurzame wijze gezonde en veilige voeding te kunnen ontwikkelen hebben we, samen met externe partners, tijdens het onderzoek dat ten grondslag ligt aan deze aanvraag (2RealGuts), meer realistische dierproefvrije darmmodellen opgezet en gevalideerd. In de laatste fase van het project werd met behulp van transcriptome analyse onderzocht in hoeverre de reactie van onze darmmodellen op voedingsstoffen representatief is voor de in vivo situatie. Uit deze analyse bleek tevens de potentie van transcriptomics voor onze commerciële partners en Life Sciences docenten op de hogeschool. De eindgebruiker kan de analyses namelijk inzetten voor bijvoorbeeld R&D doeleinden of als didactisch instrument in het bioinformatica onderwijs. Echter, we hebben geconstateerd dat het niet mogelijk bleek om zonder specialistische kennis de genexpressieprofielen in kaart te brengen én om deze betekenis te geven. Het doel van dit Top-up projectvoorstel is daarom een gebruiksvriendelijke userinterface (dashboard) te ontwikkelen waarmee de huidige data, maar zeker ook toekomstige analyses, kan worden geanalyseerd en toegepast zonder tussenkomst van een datascientist. Met dit dashboard vergroten we de impact van de ontwikkelde darmmodellen en ontsluiten we transcriptome data voor eindgebruikers zoals onze commerciële partners, docenten en studenten.