Publinova logo
product

The 3Ranker

An AI-based Algorithm for Finding Non-animal Alternative Methods


Beschrijving

The search for existing non-animal alternative methods for use in experiments is currently challenging because of the lack of both comprehensive structured databases and balanced keyword-based search strategies to mine unstructured textual databases. In this paper we describe 3Ranker, which is a fast, keyword-independent algorithm for finding non-animal alternative methods for use in biomedical research. The 3Ranker algorithm was created by using a machine learning approach, consisting of a Random Forest model built on a dataset of 35 million abstracts and constructed with weak supervision, followed by iterative model improvement with expert curated data. We found a satisfactory trade-off between sensitivity and specificity, with Area Under the Curve (AUC) values ranging from 0.85-0.95. Trials showed that the AI-based classifier was able to identify articles that describe potential alternatives to animal use, among the thousands of articles returned by generic PubMed queries on dermatitis and Parkinson's disease. Application of the classification models on time series data showed the earlier implementation and acceptance of Three Rs principles in the area of cosmetics and skin research, as compared to the area of neurodegenerative disease research. The 3Ranker algorithm is freely available at www.open3r.org; the future goal is to expand this framework to cover multiple research domains and to enable its broad use by researchers, policymakers, funders and ethical review boards, in order to promote the replacement of animal use in research wherever possible.


Onderdeel van project

5
    project

    KI-Agil

    Het doel van KI-Agil is om, speciaal voor MKB bedrijven, de voorwaarden voor de implementatie van AI en de hierop steunende innovatieve branches te verbeteren. De Hanzehogeschool Groningen en het Instituut voor Duale Studies verkennen binnen zes MKB’s de grenzen van AI en zoeken naar implementeerbare gebruikersmogelijkheden, met het doel om nieuwe werkvormen en businessmodellen in samenwerking met deze bedrijven te ontwikkelen, waarbij rekening wordt gehouden met de maatschappelijke grondbeginselen.

    Afgerond
    project

    Ingredient maps: charting the ingredient knowledge landscape

    In this project we will build a structured database of properties of food ingredients, focusing in particular on the taste and texture properties. By large-scale collection and text mining on a large number of textual resources, a comprehensive data set on ingredient properties will be created, along with knowledge on the relationships between these ingredients. This database will then be used for to find new potential applications for healthy and taste enhancing ingredient combinations by network-based discovery methods and artificial intelligence algorithms will be used. A concrete focus will be on application questions formulated by the industrial partners. The resulting hypothesis will be validated in a real life setting at the premises of the industrial partners.The deliverables of this project will be:• A reusable open-access ingredient database that is accessible via a user-friendly web portal• A set of state-of-the-art mining algorithms that can address a wide variety of industry driven use cases• Novel product formulations that can be further developed for the consumer and business2business market

    Afgerond
    project

    Dynamisch/ecologisch modelleren van reeënpopulaties in Groningen en de relatie met afschot en aanrijdingen

    In dit project wordt een computermodel opgesteld voor de populatiedynamica van reeën, in het bijzonder in de provincie Groningen, met inachtneming van factoren als natuurlijke aanwas, natuurlijke sterfte, aanrijdingen en afschot, waarbij het karakter van de omgeving en informatie betreffende verkeersdruk wordt meegenomen, teneinde inzicht te verschaffen in de relaties tussen populatiegrootte, afschot en aanrijdingen.En wordt een applicatie ontwikkeld, waarmee opdrachtgever zelf inzicht verkregen worden in de data die verzameld is en in de toekomst verzameld zal worden en de prognoses die met voorgenoemd computermodel daaruit voortvloeien.

    Afgerond


Publicatiedatum

Type

Document (PDF)

Gebruiksrecht
Niet bekend
Toegangsrecht

Niet bekend